(1)歯磨き剤の一部は口腔に残ります。この量がどれくらいになるかで安全性が決まります。日本の３〜５歳児を対象としたフッ素入り研磨剤の口腔内残留率は、平均で15％です。成人では、12.7％です。市販されているフッ素入り歯磨剤はフッ素として1000ppm以下配合されています（歯磨剤１g中に１mgのフッ素が含まれている）。
３〜５歳の子供が0.3gのフッ素入り歯磨剤を使用し、口腔内に残るフッ素量は、15％として１回当たり0.05gです。１日３回の使用で、0.135g（日本茶の135mlに相当）です。また、成人が0.5gのフッ素入り歯磨剤を使用し、口腔に残るフッ素量は、12.7％として１回当たり0.06mgになります。１日３回で0.18mg（日本茶の190mlに相当）です。

(2)米国等のように、水道水フッ化物添加等が行われている地域では、低年齢児のフッ素入り歯磨剤の飲み込みによる軽微の歯牙フッ素症が報告されています。このことにより、低年齢児の子供がフッ素入り歯磨剤を使用するときは、親の監督下で、少量（毛先の上に長さ5mm以下）使用し、また飲み込まないようにしなさいという警告がされています。こういうことがあり、ＷＨＯ（世界保健機構）では、低年齢児（６歳以下）の子供にはキャンディーのような香料の歯磨剤や1500ppm以上のフッ素濃度のものを使用させることは好ましくないと述べると共に、フッ素入り歯磨剤での歯磨きを推奨しています。

(3)急性中毒
確実な致死量（CLD）：SnF2　120〜242mg/kg（F 32〜64mg/kg）
安全耐量（STD）　 ：SnF2　 30〜60mg/kg（F 8〜16mg/kg）
見込み中毒量（PTD）：SnF2　 19mg/kg（F 5mg/kg）−中毒の兆候や症状を起こしうる量−（注：見込み中毒量（PTD）が安全耐量（STD）が確実な致死量（CLD）の1/4と示唆された概算の計算量であるのに対して見込み中毒量（PTD）は実際の中毒例に基づいているからです。）
急性経口中毒の症状：
悪心、嘔吐、唾液分泌過多、腹痛、下痢、けいれん、心不整脈、昏睡等が生じます。

(4)慢性中毒
疫学的に、普通にヒトが経験しうる慢性のフッ素中毒は、せいぜい歯牙フッ素症と骨フッ素症ぐらいのものです。体重減少や貧血が見られたり、その他諸臓器に影響が現れるのは、飲料水中のフッ素濃度が数十ppm以上の場合です。
歯牙フッ素症：軽度のフッ素症は審美上ほとんど問題はなく素人では、検出できない程度のものでフッ素添加飲料水を出生時から用いている人口集団の普通10％に見られるものです。中等度以上の症状の者はまず見られません。
米国環境庁（EPA）によると審美上問題となる歯牙フッ素症の発症値を用いて、飲料水のフッ素濃度1ppm（mg/1）を副作用の認められないレベル、2ppm（mg/1）を副作用の最低レベルとしています。また、体重20kgの子供の飲料水消費量を基礎として、0.06mg/kg/day（１日のフッ素経口摂取量）を基準量としています。
骨フッ素症：比較的高濃度のフッ素を長期間摂取していると、骨フッ素症が生じえます。例えば、フッ素濃度が8ppmを超える飲料水を20年以上使用している人口集団に、骨フッ素症が見られると言われています。初期の症状は、骨のエックス線不透過性が増加する程度です。さらに過剰摂取が続き、ひどくなると手足の自由がきかなくなり、疼痛、硬直、異常な骨形成等（運動障害性フッ素症）が生じるがめったに見られるものではありません。

(5)フッ素の発ガン性
疫学的研究ではフッ素と癌の相関関係は認めておらず、最近（1990年）の米国国立癌研究所の研究でも、フッ化物添加飲料水による発癌のリスクは上昇しないと結論されています。また、米国保健省・環境保健関連プログラム委員会でのフッ化物特別部会でも最近の動物実験の結果から、フッ素と癌との関係は立証されていないと述べています。